简单来说，起义之前的黄巢是一名科场失意的私盐贩子，权势和财富是他追逐的目标，所以将黄巢起义简单的定性为农民起义是不太合适的，如果稍微宽松一些看的话，这至少不算纯粹的农民起义。而黄巢在起义过程中所作的一切也绝不是为了农民，即便起义打出的旗号是“公平”。
任何起义或者战争，无论是正义的还是非正义的，一旦开始，就是需要大量的流血和牺牲的，而黄巢起义过程中死去的百姓更是没法计算，毕竟在正常的战争死亡之外，还有吃人一项，并且这吃人的数量是相当惊人的。而吃人之外，黄巢起义进行过程中还不乏各种丧尽天良的事情，总结起来有这些：为私利而攻城略地、攻而不守、屠城、建立伪政权、以人为食。
黄巢起义的开端是王仙芝起义，开始于874年，当时的唐朝已经是积弊很深，各种矛盾越来越难以调和，又遇到了大旱，很多百姓不得不聚众为盗，正是在这样的背景下，王仙芝振臂一呼开始和唐廷作对，他们攻城略地，不久之后私盐贩子黄巢和几个兄弟带兵加入其中，队伍越来越大，他们打出为公平而战的旗号，聚集了数万乃至数十万的贼众，然而他们的目的并不是实现所有人的公平，而是为少数人谋利益，自然起义中的领袖和小头目们是受益人。
在黄巢起义攻占了不少地方之后，朝廷为了压下起义，给了王仙芝一个官做，王仙芝一听有官做，很想第一时间答应下来，但是黄巢和其他的头目却怒了，原因是能做官的只有王仙芝，而黄巢等人却什么都没有，于是黄巢直接揍了王仙芝，起义内部第一次出现分裂。后来王仙芝也不得不继续作战，而拒绝了朝廷的招安。但在后来，王仙芝数次想要投降朝廷，但都被唐军统帅宋威有意无意的阻拦，直到877年，唐廷再次招降起义军领袖，这次考虑到了大部分的头目，但宋威却将王仙芝派去请降的几个人都杀掉，而王仙芝也在第二年战败而死。
起义军的真正领袖成为黄巢，黄巢比王仙芝的野心要大很多，黄巢想做天平军节度使，朝廷不准，接着他又想做安南都护和广州节度使，再次被拒，而朝廷许给他的官职他又看不上，于是招降在黄巢这边基本成为不可能，不过他曾骗降，为自己争取了不少时间。
王仙芝也好，黄巢也罢，在和朝廷沟通的时候，都是在争取自身利益，即想得到一个合适的官做，至于起义军以及百姓的未来，则不在他们的考虑之列。
而且起义军在攻城略地的过程中，为的只是和唐廷作对，争取有利的谈判条件，以及劫掠财物和粮草，等攻下城来，接着就开始下一个目标。至于已经攻下了的地方，抢掠一空后就不再搭理，也不会派兵驻守，更不会妥善安置百姓，恢复此地的生产。黄巢起义的一大作战特色就是流动作战，到处蹿，打完就走，不会停留。因此黄巢起义转战大半个中国，给百姓造成了巨大的损失，城镇被毁，百姓流离失所。
黄巢起义的这种作战方式，让朝廷很难在短时间内将其剿灭，况且朝廷能控制的军队并不多，依靠的还是各地存有异心的节度使。到了881年，黄巢攻进了长安，黄巢攻进长安后并没有继续追杀唐僖宗和唐军，而是在第一时间称帝建国，建立了伪齐政权。黄巢在刚进入长安的时候还传达了这样一份声明："黄王为生灵，不似李家不恤汝辈，但各安家。"
黄巢起义这么多年，别的东西不多，就是财物有的是，他们进入长安后还发放给百姓，似乎长安的百姓迎来了一个不错的时代，但是义军抢掠惯了，突然在长安安定下来，不再抢了，这几乎是不可能的事情，实际上很多黄巢军在安静了一段时间后开始劫掠百姓，连黄巢也约束不了这些黄巢军。
《资治通鉴》记载：曾有人在尚书省涂写了一首诗来嘲讽黄巢军，尚让知道后，直接把当时尚书省中的官员和侍卫的眼睛全部挖出来，然后又将他们倒悬着挂在门前，而接着在全城搜捕会写诗的人，抓到就是杀死，一次就杀了三千多人，而抓到的能识字的人则直接让他们服贱役，凡此种种，让百姓和曾经的唐廷官员人心惶惶。
士兵们忙着劫掠，而黄巢忙着置办后宫，谁也没有考虑政权建立之后，如何治理国家，如何恢复生产，让百姓安居乐业。而实际上百姓都被逼着逃到了山中，生产无法恢复，赋税就没有，储存的粮食也渐渐供不上，米价蹭蹭往上冒，《旧唐书》记载：“米斗三十千”。接着就发生了这样一幕：
官军皆执山砦百姓，鬻于贼为食，人获数十万。
官军向黄巢军卖百姓为食，所以黄巢在长安的时候，食人事件已经开始，并且愈演愈烈，这样的政权注定是长久不了的。唐军一直在组织反击，甚至各地的勤王师已经开始陆续出动，882年，王处存的忠武军一度攻进了长安城，黄巢和他的黄巢军被迫躲到了灞上，不过唐军进入长安城中后也是只顾着抢掠财物而给了黄巢可乘之机，又将唐军赶出，在黄巢知道百姓曾帮助唐军进城后，他下达了一个可怕的指令：屠城。
《旧唐书》载：“贼怒坊市百姓迎王师，乃下令洗城，丈夫丁壮，杀戮殆尽，流血成渠。”
这样的场景光想象都觉得残忍。也正是因为黄巢的自私、残暴，黄巢军一直在走下坡路，连老奸巨猾的朱温也投降了唐廷，唐廷的大反扑很快就开始了。883年的四月，黄巢就不得不放弃长安，转向商山，围困陈州近一年的时间，也就是在这里，大规模的食人开始。
《新唐书》载：人大饥，倚死墙堑，贼俘以食，日数千人，乃办列百巨碓，糜骨皮于臼，并啖之。
即便数量上上又夸大成分，但吃人事件应当是确凿无疑的。
最终在884年的六月，黄巢被杀，黄巢起义算是基本结束，不过在后期，还有秦宗权率领部分贼众劫掠百姓，以人为军粮。
黄巢起义无疑是中国历史上的一场浩劫，百姓死伤无数，而造成这场浩劫的正是黄巢和王仙芝，当然也有唐廷，因此，无论如何，将黄巢看作是正义的是不合适的。
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